L’agriculture biologique est un système de production agricole spécifique qui exclut l'usage d’engrais et de pesticides de synthèse, et d'organismes génétiquement modifiés.
Il s'agit d'un système qui gère de façon globale la production en favorisant l'agrosystème, mais aussi la biodiversité, les activités biologiques des sols et les cycles biologiques.
Les agriculteurs qui pratiquent ce type d'agriculture misent, par exemple, sur la rotation des cultures, l'engrais vert, le compostage, la lutte biologique, et le sarclage mécanique pour maintenir la productivité des sols et le contrôle des maladies et des parasites. Les méthodes biologiques sont étudiées en agroécologie.
L'agriculture biologique peut être considérée comme une des approches de l'agriculture durable, la différence étant que l'épithète "biologique", ou son abréviation "bio", implique une certification (le plus souvent "Ecocert" ) attribuée correspondant à des normes, et que le mot est souvent  légalement protégé.